La historia se desarrolla en un mundo fantástico repleto de bestias maléficas, tesoros ocultos y los hunters o «cazadores». Los hunters son individuos que se aventuran en peligrosas misiones para desentrañar los secretos del mundo. El protagonista, Gon Freecss, es un joven decidido a convertirse en hunter para encontrar a su padre, Ging Freecss, quien desapareció cuando él era un niño.
Para alcanzar su objetivo, Gon se presenta a los exámenes de hunter, donde debe demostrar sus habilidades en un entorno repleto de desafíos. Durante este proceso, entabla amistad con otros aspirantes:
- Leorio: Un joven alegre y siempre vestido con traje y gafas de sol, que sueña con convertirse en médico.
- Kurapika: Un chico rubio serio, portador de una mirada enigmática, motivado por la venganza contra quienes destruyeron su clan.
- Killua: Un joven que proviene de una familia de asesinos, que se muestra indiferente ante la vida pero posee habilidades excepcionales.
Juntos, este grupo de amigos se enfrenta a una serie de retos y adversidades, tanto de criaturas como de humanos malvados, mientras desarrollan sus habilidades y personalidades en un entorno lleno de acción y emoción.