La historia retoma la vida de Sakura y Syaoran, quienes ahora comienzan la escuela secundaria. Después de un periodo de calma tras el Final Judgment, Sakura espera que su vida escolar sea tranquila. Sin embargo, un nuevo desafío se presenta cuando todas sus cartas de Clow se vuelven blancas. Este misterioso fenómeno la lleva a descubrir un nuevo poder que transformará su comprensión sobre sus habilidades mágicas.